sequencher软件入门教程 诚信代理

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Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年，Sequencher提供了**的功能特征，成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果，而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法，可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
Multiplex ID
Sequencher 5.2或之后的用户使用基于BWA, GSNAP 或Velvet从头或基于参考组件的复用方法。复用方法快速而*。每个DNA样本都有与其相关的特定条形码。Sequencher可以阅读这些条形码并将数据分成不同的文件或‘bins’。Sequencher获取每个‘bin’中的序列，并为您执行汇编或对齐。Sequencher的Multiplex ID可与单端或成对端数据一起使用。对于成对的端数据，每个读数在5’端必须有相同的条形码，可以被识别为一对。您可以使用Tablet阅读器查看多路复用组件或对齐的结果。


SNP分析
筛选下一代测序所产生的数以百万计的读物在寻找候选SNPs时面临重大挑战。Maq和GSNAP算法都包括SNP筛选功能。Maq具有两级筛选过程，初搜索读取和参考序列之间的差异。接着，筛选初始结果的过滤步骤，寻找每列读取的相同类别的小数量，以及嵌入在高质量区域内的变体。综合报告中给出了结果，您还可以在Maqview或Tablet中查看结果。


使用GSNAP，SNP分析采取不同的方法，查看之前报告的SNPs以及新的候选SNPs。用户必须提供已知的SNPs列表以及读取和参考序列。GSNAP对所有主要和次要等位基因进行SNP耐受性排列。该算法使微小等位基因与错配区分开来。综合报告中给出了结果，您还可以在Tablet中查看结果。

Sequence AssemblyStringency
Sequencher's intuitive controls allow you to set your sequence assembly parameters and adjust them within seconds, allowing you to assemble your DNA fragments quickly and accurately. Sequencher will automatically compare the forward and the reverse-complement orientations to assemble the best possible contigs, so you can assemble DNA sequences regardless of orientation.
Apply Sequencher's versatile assembly tools to
Compare gene variants to a reference sequence
Confirm vector constructs
Assemble viral and bacterial genomes
Cluster tens of thousands of sequences from cDNA libraries
Assemble cDNA to genomic sequence
Create a primer map

Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年，Sequencher提供了**的功能特征，成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果，而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法，可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
Find Amino Acids
Sequencher中的Find Amino Acids命令允许快速识别数据中的个体或序列。使用单字母代码，插入您希望找到的，Sequencher会发现并**那些序列中的碱基。Sequencher通过在Find Amino Acids窗口选择Find Next按钮，可以轻松地进入符合搜索的下一组碱基。


方差表
SNP分析的有力工具
现在有一种非常简单的方法来比较DNA序列或重叠序列，并点击几下就可以找到这些序列之间的所有差异。方差表让您筛选大量的序列数据，这样您就可以快速可视化您感兴趣的碱基。方差表中的每个单元格都链接到其原始数据，因此您可以直接在表中直接验证或编辑每个假定的差异，并使序列和色谱数据自动更新。一旦发现所有差异，Sequencher会为您提供多种导出和报表选项。


转换方差表
转换方差表总结了选定的一组样品中的所有差异。因为表与底层序列数据相连，所以它是验证突变导致转换改变和检查表达载体的理想选择。
与将引用匹配为空白单元格的方差表不同，转换后的方差表以浅灰色显示匹配。这让您能看到密码子的差异，这些密码子仍然会导致的匹配。您甚至可以在复查模式中同时看到方差表和转换方差表，这样您就可以地确定哪一个DNA序列改变导致蛋白质序列改变。


报告
Sequencher输出报表创建数据的可打印版本。这些报告提供了分析工具，例如在人口报告中对类似样本进行聚类。人口报告是方差表中数据的总结。每个人口报告由两种类型的表组成：一个人口表和几个单的详细表，它们描述了人口表中的每个组。


Sequencher中方差详细报告提供了支持方差表的所有信息。与个别差异报告一样，汇总表列出每个样本或列的变体。另外，在差异详细报告中，详细表遵循所描述的变体中的每一个的变体表。本表中的详细内容包括序列名称、方向以及任何数据的碱基调用，有助于调用变体。如果置信度或色谱数据可用，这也包括在表中的每个序列中。色谱数据包括二次峰分布的细节和每个变体多达六个踪迹的色谱图，尽管每个变体的踪迹数量是可配置的。

Sequencher DNA序列分析软件是科学家们*的工具。持续发展和改进**过25年，Sequencher提供了**的功能特征，成千上万的出版物都有相关的应用介绍。新手用户可以以少的时间投资产生结果，而有经验的用户会惊叹于功能的深度和控制。Sequencher自带各种专有算法，可以为Sanger, Next-Gen Sequencing (NGS)和RNA-Seq序列数据生成结果。
Sanger序列
Sequencher使传统的序列装配变得*，同时又能让您保持对序列的控制。精简数据质量差的序列。您甚至可以创建一个整洁的标准库，让一切变得更简单。通过直观的控制，您可以为数据选择佳算法，包括汇编到参考中。如果您正在处理来自不同来源的多个示例，可以通过名称来对它们进行自动装配。使用工具编辑数据从来没有如此简单过，帮助您定位和处理模棱两可的问题，还可以检查杂合子并移动您的数据。使用信任值帮助修整数据、质量检查和SNP检测，以提高数据结果的质量。


序列编辑
Sequencher提供一个DNA序列编辑工具，您需要确保这个序列是正确的。您可以在一个序列中查看一次您的色谱数据或在正向和反向方向查看多个对齐的色谱图。


它可以快速、方便地滚动对齐的数据，或者可以使用Sequencher的选择工具来**区域的差异或低质量。
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