GPMAW正版软件入门教程 保证正版

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A5 The leftmost panel shows the total mass of the protein in Daltons. The button next to it shows whether it is the average mass (Av. – blue) or monoisotopic mass (Mo. – red). You can change the mass type by clicking on the Av./Mo. button.
The next two panels from the left can show either of two states:
A6 If no peptide is selected the mass of the amino acid under the cursor (i.e. the residue mass + 18 Da) will be displayed in the left-hand panel and the right-hand panel will show the residue number (if the protein is a multi-chain protein, the first chain will be labeled ‘a’, the second ‘b’ etc (i.e. 80b is residue number 80 in the second chain counting from the N-terminus).

质量分析:蛋白质可以通过自动方法(如定义酶作用的灵活命名法)或手动方法进行裂解。多肽显示与许多参数(各种质量值- mono, ave，电荷- Bull&Breese指数，HPLC指数，pI，电荷)，并可以进一步工作(如交联，新的分裂)。

生物信息学:可显示多种图形、疏水性、点图、二级结构预测。可以在本地数据库上执行BLAST搜索。使用ClustalW的多重对齐。CustalW可执行文件现在是GPMAw包的一部分，但是在以前的版本中，您必须自己安装。

The GPMAW program is primarily intended as a tool for mass spectrometric analysis of proteins and peptides. However, a number of other bioinformatics tools have been included, so the use of the program extends far beyond simple mass analysis.


‘Invert sequence’ will result in highlighting of sequences found in both N- and C-terminal directions (e.g. if entering KLGFT both the sequence KLGFT and the sequence TFGLK will be highlighted). Useful for searching for a ms/ms sequence tags (you may not know whether it is a y-ion or a b-ion series). Isobaric resides will, if checked, highlight both kinds of residues, i.e. if the ‘Q/K’ checkbox is checked and the sequence LKT is entered, the sequence LQT will also be highlighted. Again, this is for the benefit of ms/ms sequence tags.

显示1个或3个字母
平均质量/单同位素质量
固定残留物宽度
带有序列信息的提要栏
显示二硫化物桥、改性残留物等
通过**显示部分序列，您可以轻松获得给定肽的质量。为了便于导航，您可以使用特定颜色的残留物（提供三种不同颜色和下划线）。大多数设置可以很*地在系统设置框中预先设置。
序列窗口形成父窗口，从中可以创建大量派生子窗口：
肽窗口
MS/MS窗口
批量搜索、合成搜索
图表：疏水性、二级结构、电荷与酸碱度、点图、α螺旋轮
肽窗口
肽窗口通常通过自动摘要命令从序列窗口中调用。但是，也有其他方法，如手动或半自动分裂。
Sequence window
The sequence window is the central window of GPMAW and default view of a sequence. From here you can call most of other sequence related functions (either through the menu, the toolbar, or the pop-up menu).
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