使用期限*
许可形式单机和网络版
原产地丹麦
介质下载
适用平台Windows
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GPMAW蛋白质质量分析软件
GPMAW程序主要是作为蛋白质和多肽质谱分析的工具。然而,许多其他生物信息学工具也已经包含在内,因此该程序的使用远远**出了简单的质量分析。
该程序可以运行在Windows 2000(即2000,XP, Vista, Win7)以后的所有32位版本的Windows上。它也可以运行在当前的64位版本上,但是还没有在这个平台上进行完整的测试。它也可以在Mac系统的Windows虚拟机上运行,但不能保证完全兼容。
除了ms/ms搜索,该程序不需要强大的处理器或快速硬盘,可以在任何系统上运行。运行ms/ms搜索您需要一个SVGA+分辨率的屏幕,或者您可以在上网本上运行它。
程序内容
GPMAW的文档在帮助栏中提供,手册可以在下载。
![GPMAW云盘](//l.b2b168.com/2022/08/19/10/202208191019463230234.jpg)
肽窗口列出了从给定蛋白质产生的所有肽以及大量(>20)物理化学参数。
充电-单次/多次/负/正
肽数
位置
液相色谱指数
理论PI
布尔和布雷斯指数
序列-1/3字母等
肽可以通过部分解理生成(图中蓝色上标表示),改性界点、改性残渣,即使是部分修改也得到有限的支持。为便于在序列窗口中引用着色的特定残留物而被带到这个窗口。用户可以配置显示的实际参数。通过单击标题,可以对任何列进行排序。*二次单击将反转排序。通过工具栏和/或弹出菜单(鼠标右键单击),您可以访问与消化(如模拟的HPLC反相色谱图)或当前所选肽(MS/MS裂解、肽信息、电荷与ph图)相关的其他功能。
自GPMAW 6.20开始,用户可以修改定义的pka值,并且从6.21开始也可以在常规质量表中定义。
GPMAW如何使用这些pka值?对于修改,这是相当简单的,每当它被定义在一个序列中时,pka值被纳入pi和电荷的计算中(也就是说,当残留物通过相关的修改进行修改时)。但是,对于mass文件,您必须特别告诉GPMAW使用用户定义的表,因为GPMAW可以使用四个不同的表。要在这些表之间切换,请输入系统设置,在对话框的页上,您将找到以下选择:
![GPMAW云盘](//l.b2b168.com/2020/06/18/15/202006181534436222934.jpg)
Molar Ext./Abs.@280: Theoretical extinction coefficient / absorption of the protein at 280 nm.
Highlights: Percentage of the sequence, which is inverted (highlighted) or underlined, updated dynamically.
Sel. mass: Mass of the selected (highlighted) part of the sequence. Shown as singly, doubly and triply charged peptide (i.e. residue mass + 18 + charge). Updated dynamically. Note that unlike the peptide mass shown in the toolbar of the sequence window, this is the charged ion. More on peptide selections in part 3.
![GPMAW云盘](//l.b2b168.com/2019/07/18/10/201907181030459619184.jpg)
The status bar is initially green, but turns yellow and red as you get close to full capacity of the file. Furthermore, when a protein is selected, the basic information is displayed in the right-hand information box.
19年来,公司始终秉承、专注、专心的发展理念,厚积薄发,积累了大量的人才、技术以及行业经验,在行业内得到了大量用户的认可和高度价。
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