正规代理 购买GPMAW软件及培训班
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产品描述

使用期限* 许可形式单机和网络版 原产地丹麦 介质下载 适用平台Windows
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GPMAW程序主要是作为蛋白质和多肽质谱分析的工具。然而,许多其他生物信息学工具也已经包含在内,因此该程序的使用远远**出了简单的质量分析。
该程序可以运行在Windows 2000(即2000,XP, Vista, Win7)以后的所有32位版本的Windows上。它也可以运行在当前的64位版本上,但是还没有在这个平台上进行完整的测试。它也可以在Mac系统的Windows虚拟机上运行,但不能保证完全兼容。
除了ms/ms搜索,该程序不需要强大的处理器或快速硬盘,可以在任何系统上运行。运行ms/ms搜索您需要一个SVGA+分辨率的屏幕,或者您可以在上网本上运行它。
程序内容
GPMAW的文档在帮助栏中提供,手册可以在下载。
序列处理:通过在Entrez和本地数据库(FastA格式和Swiss-Prot)中直接搜索数据库,从许多不同格式的序列中导入序列。序列可以保存在本地(数据库)中,以备将来参考。从序列窗口可以执行大量操作。序列可以以FastA格式导出(单个序列或同时导出所有序列),以便于传输到其他程序。
质量分析:蛋白质可以通过自动方法(如定义酶作用的灵活命名法)或手动方法进行裂解。多肽显示与许多参数(各种质量值- mono, ave,电荷- Bull&Breese指数,HPLC指数,pI,电荷),并可以进一步工作(如交联,新的分裂)。
生物信息学:可显示多种图形、疏水性、点图、二级结构预测。可以在本地数据库上执行BLAST搜索。使用ClustalW的多重对齐。CustalW可执行文件现在是GPMAw包的一部分,但是在以前的版本中,您必须自己安装。
The GPMAW program is primarily intended as a tool for mass spectrometric analysis of proteins and peptides. However, a number of other bioinformatics tools have been included, so the use of the program extends far beyond simple mass analysis.
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肽窗口列出了从给定蛋白质产生的所有肽以及大量(>20)物理化学参数。
充电-单次/多次/负/正
肽数
位置
液相色谱指数
理论PI
布尔和布雷斯指数
序列-1/3字母等
肽可以通过部分解理生成(图中蓝色上标表示),改性界点、改性残渣,即使是部分修改也得到有限的支持。为便于在序列窗口中引用着色的特定残留物而被带到这个窗口。用户可以配置显示的实际参数。通过单击标题,可以对任何列进行排序。*二次单击将反转排序。通过工具栏和/或弹出菜单(鼠标右键单击),您可以访问与消化(如模拟的HPLC反相色谱图)或当前所选肽(MS/MS裂解、肽信息、电荷与ph图)相关的其他功能。
自GPMAW 6.20开始,用户可以修改定义的pka值,并且从6.21开始也可以在常规质量表中定义。
GPMAW如何使用这些pka值?对于修改,这是相当简单的,每当它被定义在一个序列中时,pka值被纳入pi和电荷的计算中(也就是说,当残留物通过相关的修改进行修改时)。但是,对于mass文件,您必须特别告诉GPMAW使用用户定义的表,因为GPMAW可以使用四个不同的表。要在这些表之间切换,请输入系统设置,在对话框的页上,您将找到以下选择:
The display can be configured in multiple ways:
1- or 3-letter display, 
average mass/monoisotopic mass, 
fixed residue width, 
sidebar with sequence information, 
display disulfide bridges, modified residues etc.
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以上显示的,可以有多种配置方式:
显示1个或3个字母
平均质量/单同位素质量
固定残留物宽度
带有序列信息的提要栏
显示二硫化物桥、改性残留物等

通过**显示部分序列,您可以轻松获得给定肽的质量。为了便于导航,您可以使用特定颜色的残留物(提供三种不同颜色和下划线)。大多数设置可以很*地在系统设置框中预先设置。

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肽窗口列出了从给定蛋白质产生的所有肽以及大量(>20)物理化学参数。
充电-单次/多次/负/正
肽数
位置
液相色谱指数
理论PI
布尔和布雷斯指数
序列-1/3字母等
肽可以通过部分解理生成(图中蓝色上标表示),改性界点、改性残渣,即使是部分修改也得到有限的支持。为便于在序列窗口中引用着色的特定残留物而被带到这个窗口。用户可以配置显示的实际参数。通过单击标题,可以对任何列进行排序。*二次单击将反转排序。通过工具栏和/或弹出菜单(鼠标右键单击),您可以访问与消化(如模拟的HPLC反相色谱图)或当前所选肽(MS/MS裂解、肽信息、电荷与ph图)相关的其他功能。
以及精美的图片都可以轻松完成。
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