Beacon designer软件教程教你怎样用 保证正版

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Beacon Designer 为qPCR检验设计和的oligos
自动化实时PCR引物和探针设计
Beacon Designer可以自动设计实时引物和探针。它被世界各地的分子生物学家用来设计成功的实时PCR分析。它节省了很多失败的实验所浪费的时间和金钱。Beacon Designer是实时引物和探头设计的灵活的解决方案。
Specific and Efficient Design: How Beacon Designer™ Makes it Possible?
You can BLAST search sequences and search for template structures from within the program. The results of both these searches are used while designing primers and probes. The regions that exhibit significant cross homologies and template structures are avoided automatically during the design.

双标记探针的设计
Beacon Designer目前支持四种基于探针的化学物质：
 TaqMan探针
使用Beacon Designer优化TaqMan探针，帮助您研究差异基因表达或使用TaqMan SNP基因型检验研究SNP（单核苷酸多态性）。您也可以选择设计越来越流行的锁定核酸（LNA）取代TaqMan探针，这些探针比标准TaqMan探针更稳定。为了研究DNA甲基化，Beacon Designer帮助设计引物和TaqMan探针进行甲基化分析。甲基光是一种高通量分析，用于区分甲基化和非甲基化DNA。使用Beacon Designer，通过设计甲基化和未甲基化链的寡核苷酸，以及未经处理的DNA序列，可以设计合适的控制引物和探针。有了这些化学物质，您可以评估预先设计的引物或TaqMan探针。设计结果按顺序排列，给您一个可供选择的替代品列表。根据oligo的属性分配等级。
SYBR® Green Primer Design
TaqMan® Probe Design
Multiplex Real Time PCR Assay Design
HRMA Primer Design
MethyLight TaqMan® Design
Molecular Beacon Design
NASBA® Assay Design
FRET Probe Design

Beacon Designer 为qPCR检验设计和的oligos
Molecular Beacons
为NASBA检验设计或评估标准的分子信标或分子信标。NASBA是一种引物依赖技术，可用于在同一温度下单个混合物中连续扩增核酸。现在您可以为单分子模板或多重反应的分子信标设计NASBA检验。
Scorpions
Beacon Designer支持Scorpions引物和探针的设计。Scorpions的分析是很重要的，它们与探针的酶切割无关。引物和探针元件在反应过程中物理耦合。
FRET探针
Beacon Designer支持设计和评估预先设计的FRET探针。与预先设计的SYBR Green引物兼容的FRET探针可以在Beacon Designer中设计。
多路实时PCR检验
有了Beacon Designer，您可以设计基于TaqMan的多路复用实时PCR检验，包括参考基因选择。
Scorpions® Design
Avoiding Cross Homology- For Specific Oligo Design
Avoid Template Structures- Increase Primer Efficiency
Oligo Rating

Salient Features Supported for MethyLight Assays in Beacon Designer™
a) Prediction of CpG islands in the DNA sequence.
b) Design methyl specific primers and TaqMan® probes.
c) Design suitable control primers and TaqMan® probes for corresponding unmethylated and untreated sequences.
d) Analyze pre-designed/published primers and/or TaqMan® probes and design of compatible oligos.
e) Primers and TaqMan® probes are designed by avoiding regions of homology identified by automatically interpreting BLAST search results.
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