使用期限*
许可形式单机和网络版
原产地丹麦
介质下载
适用平台Windows
科学软件网提供的软件上千款,涉及所有学科领域,您所需的软件,我们都能提供。科学软件网提供的软件涵盖领域包括经管,仿真,地球地理,生物化学,工程科学,排版及网络管理等。同时,还提供培训、课程(包含34款软件,66门课程)、实验室解决方案和项目咨询等服务。
肽窗口列出了从给定蛋白质产生的所有肽以及大量(>20)物理化学参数。
充电-单次/多次/负/正
肽数
位置
液相色谱指数
理论PI
布尔和布雷斯指数
序列-1/3字母等
肽可以通过部分解理生成(图中蓝色上标表示),改性界点、改性残渣,即使是部分修改也得到有限的支持。为便于在序列窗口中引用着色的特定残留物而被带到这个窗口。用户可以配置显示的实际参数。通过单击标题,可以对任何列进行排序。*二次单击将反转排序。通过工具栏和/或弹出菜单(鼠标右键单击),您可以访问与消化(如模拟的HPLC反相色谱图)或当前所选肽(MS/MS裂解、肽信息、电荷与ph图)相关的其他功能。
自GPMAW 6.20开始,用户可以修改定义的pka值,并且从6.21开始也可以在常规质量表中定义。
GPMAW如何使用这些pka值?对于修改,这是相当简单的,每当它被定义在一个序列中时,pka值被纳入pi和电荷的计算中(也就是说,当残留物通过相关的修改进行修改时)。但是,对于mass文件,您必须特别告诉GPMAW使用用户定义的表,因为GPMAW可以使用四个不同的表。要在这些表之间切换,请输入系统设置,在对话框的页上,您将找到以下选择:
The display can be configured in multiple ways:
1- or 3-letter display,
average mass/monoisotopic mass,
fixed residue width,
sidebar with sequence information,
display disulfide bridges, modified residues etc.
The status bar is initially green, but turns yellow and red as you get close to full capacity of the file. Furthermore, when a protein is selected, the basic information is displayed in the right-hand information box.
The scissors are a shortcut to cutting up the protein into peptides. This is usually done using proteolytic enzymes, but may also be carried out chemically. The only requirement is that the process can be specified relative to specific residues. The small down-arrow button opens a menu enabling you to select enzyme cleavage in a single click. Note that the bottom part of the menu enables you to specify one missed cleavage, and/or to digest all opened sequence windows.
和*三个是从文献中得出的值(参考在线帮助和手册)。*二个选项基于游离残基的值。*四个和后一个选项基于当前选定的mass文件中的定义,必须选中才能使用这些值。
哪里使用这些值呢?
在各自的信息对话框中计算蛋白质和肽的PI值(从蛋白质或肽窗口,选择“蛋白质/肽信息)。如果选择了列选项,则在肽窗口中计算PI值。
模拟的2-D凝胶使用PI计算。
在DigestAlyzer中,可以选择Pi作为一个轴选项。
在肽窗口中报告电荷。
从蛋白质和肽窗口中调用电荷与ph窗口。
当前的局限
如果修改了带电残留物,则原始pka值仍作为总pi/电荷的一部分进行计算。如果未充电的残余物变为带电的残余物并pka值,则计算“正确”。如果一个界点被修改,它仍然会产生π/电荷。
科学软件网主要提供以下科学软件服务:
1、软件培训服务:与国内大学合作,聘请业内人士定期组织软件培训,截止目前,已成功举办软件培训四十多期,累计学员2000余人,不仅让学员掌握了软件使用技巧,加深了软件在本职工作中的应用深度,而且也为**业人士搭建起了沟通的桥梁;
2、软件服务:提供软件试用版、演示版、教程、手册和参考资料的服务;
3、解决方案咨询服务:科学软件网可向用户有偿提供经济统计、系统优化、决策分析、生物制药等方面的解决方案咨询服务;
4、软件升级及技术支持服务:科学软件网可向用户提供软件的本地化技术支持服务,包括软件更新升级、软件故障排除、安装调试、培训等;
5、行业研讨服务:科学软件网会针对不**业,邀请国内外以及软件厂商技术人员,不定期在国内举办大型研讨会,时刻关注*技术,为国内行业技术发展提供导向。
http://turntech8843.b2b168.com