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"I have worked with Beacon Designer and it is truly the perfect software to design primers for real-time PCR" – Dr. Sushmita Chakraborty, Heidelberg University.
"AlleleID has been of much help for designing primers for real time PCR. It has facilitated the work enormously." -Dr. Flavia M.Michelini, Universidad de Buenos Aires, Argentina.
Evolution of Enterohemorrhagic Escherichia coli O26 Based on Single-Nucleotide Polymorphisms Stefan Bletz, Martina Bielaszewska, Shana R. Leopold, Robin Köck, Anika Witten, Jörg Schuldes, Wenlan Zhang, Helge Karch, Alexander Mellmann.
Genome Biology and Evolution. 2013;5(10):1807-16. doi: 10.1093/gbe/evt136.
引物特异性可以通过执行BLAST搜索和从程序内部搜索模板结构来实现。这两种搜索结果都用于设计引物。引物设计过程中，会自动避免出现显著交叉同源性和模板结构的区域。
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