科学软件网_AlleleID物种识别和分类鉴别的综合软件

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AlleleID 物种识别和分类鉴别的综合软件
的实验设计
AlleleID是一款旨在解决、病原体检测或物种的综合性桌面工具。以CulsSTW多序列比对为核心，AlleleID可以设计用于物种识别/交叉物种的基因芯片探针以及用于实时PCR的SYBR Green, TaqMan MGB, TaqMan探针, Molecular Beacons以及实时PCR引物。AlleleID还提供了支持可变剪切片段检测的微阵列实验设计。
物种分析/跨物种实验/等位基因分析
AlleleID使用ClustalW对序列进行排列，并分析保存和物种特定区域。您可以使用程序进行实时PCR引物设计（包含SYBR Green引物设计）和双标签探针设计（TaqMan probes,
TaqMan MGB and molecular beacons）。这些检测方法只用于进行菌株检测或从混合菌株中找到感兴趣的物种。为了进行交叉物种试验，AlleleID通过识别保守区域来设计通用探针。对于相关的生物体，当研究物种的基因组草图不可用时，可以使用AlleleID来研究其基因表达。这些强大的功能可以帮助解决了很多具有挑战性的难题，例如的检测、、定量以及污染物、环境等的监测。

物种鉴定分析/跨物种鉴定/等位基因鉴定分析AlleleID®使用ClustalW校准序列并分析保守和物种特定区域。然后，您可以使用该程序进行实时PCR引物设计(包括SYBR®绿色引物设计)和双标记探针设计(TaqMan®探针，TaqMan®MGB探针和分子信标)。这些试验的目的是只检测菌株(应变检测)或感兴趣的种从混合物。

For cross species assays, AlleleID® identifies the conserved regions to design a universal probe. For related organisms, AlleleID® can be used to study gene expression when genome draft of the organism under study is not available.

AlleleID® designs exon probes. Such probes are important to confirm the presence of an exon in the variant.
Technical resource on Gene Splicing.
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