使用期限*
许可形式单机
原产地美国
介质下载
适用平台windows
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Real Time PCR & Microarray Primer/Probe Design for Cross Species and Taxa Specific Applications
For cross species assays, AlleleID® identifies the conserved regions to design a universal probe. This functionality is especially useful to detect a species or a taxa when designing a diagnostic assay. This functionality is also useful to help study gene expression when genome draft of the organism under study is not available.
检测成功的复杂算法
高度特寡核苷酸通过回避自动注释BLAST搜索结果找到的显著同源性区域而设计。实时定量PCR引物和探针阻止模板形成二级结构提升效率。"Minimal Set",该程序具创新性的特点之一,有助于设计少数量的等位基因特寡核苷酸引物和双标记探针,其特地识别来自混合物的所需物种/菌株/类群中的每一个,降低化验成本。对于类群或跨种分析,当类群或类群高度不同时,该特征尤其有用。对于一组预先设计的、经过验证的引物,AlleleID可以设计兼容的引物和探针的其余序列的物种或类群特检测。
广泛支持实时或定量PCR检测和SNP/表达微阵列
AlleleID可以设计优的SYBR Green引物、TaqMan探针、TaqMan Minor Groove Bingding
(MGB)探针、FRET探针或者分子信标,用于实时定量PCR差异基因表达SNP基因型分类试验。您也可以设计实时PCR引物和双标记探针多达一万个序列在一个单一的运行SNP检测或表达微阵列。
设计Luminex xMAP试验
基于Luminex’s xMAP技术,AlleleID可以设计应用于悬浮阵列系统的应变-微分多重分析设计。如果您研究的是密切相关的生物体,这个功能可以帮助您在一个反应体系中进行等位基因特引物延伸(ASPE)和DHA检测。
多路连接依赖探针扩增(MLPA)检测拷贝数和突变检测
AlleleID是设计MLPA合成探针或者由MRC Holland引入的多重连接依赖探针扩增技术的程序,当合适的工具包不可用时,研究人员能够扩展这项技术。这是一种快速增长的高通量基因图谱分析方法。可以检测外显子缺失、拷贝数变化和CpG甲基化模式。具有成本效益合适、敏感性高、特好和可再生性好等特点。
AlleleID为PamGene检测设计了mRNA特,DNA特和突变特MLPA探针。这将使PamChip用户在使用PamGene高精度检测平台时设计自己感兴趣的基因探针检测。结合这两种技术,拷贝数的变化和突变可以很*地在6小时内检测到。
AlleleID® is a comprehensive desktop tool designed to address the challenges of bacterial identification, pathogen detection or species identification.
AlleleID 物种识别和分类鉴别的综合软件
的实验设计
AlleleID是一款旨在解决、病原体检测或物种的综合性桌面工具。以CulsSTW多序列比对为核心,AlleleID可以设计用于物种识别/交叉物种的基因芯片探针以及用于实时PCR的SYBR Green, TaqMan MGB, TaqMan探针, Molecular Beacons以及实时PCR引物。AlleleID还提供了支持可变剪切片段检测的微阵列实验设计。
功能特征
物种试验
基因芯片的基因拼接/选择性剪接
外显子连接引物设计
实时PCR引物设计
TaqMan探针设计
SyBR绿色底漆设计
分子信标设计
FRET探针设计
微阵列探针设计
精密化验设计
数据库支持
输入输出格式
ross Species/Taxa Specific Assays
Species Identification Assays
Gene Splicing/Alternative Splicing using Microarrays
Exon Junction Primer Design
Real Time PCR Primer Design
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